შერჩეული ციტოკინების დნმ-ის მეთილირების პროფილი კისტური ფიბროზის დროს
DOI:
https://doi.org/10.52340/jecm.2023.03.06საკვანძო სიტყვები:
DNA, methylation profile, cytokines, Cystic Fibrosisანოტაცია
კისტური ფიბროზი (CF) არის სიცოცხლისთვის საშიში, ყველაზე გავრცელებული აუტოსომური რეცესიული დაავადება თეთრკანიან პოპულაციაში, რომლის სიხშირეა დაახლოებით 1:3000. გენი, რომელიც კოდირებს კისტური ფიბროზის ტრანსმემბრანული გამტარობის მარეგულირებელ (CFTR) ცილას, გვხვდება 7 q31.2 ქრომოსომაზე. CF ხასიათდება სასუნთქი გზების მორეციდივე ინფექციებით, მომატებული ქლორით ოფლში, პანკრეასის და ღვიძლის უკმარისობით, ნაწლავის ანომალიებით, დიაბეტით, მეკონიუმის გაუვალობით (MI) და სხვა სიმპტომებით. სასუნთქი გზების ქრონიკული დისფუნქცია და ანთება პაციენტების ავადობისა და სიკვდილიანობის ძირითადი მიზეზია. ამ ანთებას ახასიათებს ფილტვებში ანთებითი ციტოკინების გაზრდილი სინთეზი. წარმოდგენილი კვლევის მიზანია ანთებითი და ანთების საწინააღმდეგო ციტოკინების (IL-8, TNFα IL-10) პრომოტორების მეთილირების დონეების იდენტიფიცირება და ამ ციტოკინების რაოდენობრივი ანალიზი კისტური ფიბროზით დაავადებულ პაციენტებში. ციტოკინების პრომოტორების დნმ-ის მეთილირების ანალიზი განხორციელდა მეთილირება სპეციფიკური პოლიმერაზული ჯაჭვური რეაქციით. დნმ-ის ფრაგმენტები ამპლიფიცირდა მეთილირებული ან არამეთილირებული დნმ-ის სპეციფიკური პრაიმერების გამოყენებით. მეთილირების ანალიზმა გამოავლინა IL-8 და TNFα გენის პრომოტორული რეგიონების სტატისტიკურად მნიშვნელოვანი ჰიპომეთილირება, მაშინ როცა IL-10 გენის პრომოტორის CpG საიტები ჰიპერმეთილირებული იყო კისტური ფიბროზით დაავადებულ პაციენტებში საკონტროლო პირებთან შედარებით. ამრიგად, დაავადების ადრეულ ეტაპზე დაავადების მამოდიფიცირებელი ეპიგენეტიკური ფაქტორების იდენტიფიკაცია გადამწყვეტია კისტური ფიბროზით დაავადებული პაციენტების მკურნალობის ახალი თერაპიული გზების ძიებისთვის და პერსონალიზებული მიდგომების შესამუშავებლად.
Downloads
წყაროები
Kerem B, Rommens JM, Buchanan JA, Markiewicz D, Cox TK, Chakravarti A, Buchwald M, Tsui LC. (1989) Identification of the cystic fibrosis gene: genetic analysis. Science. Sep 8;245(4922):1073–1080.
Hartl D., Gaggar A., Bruscia E., Hector A., Marcos V., Jung A., Greene C., McElvaney G., Mall M., Döring G. (2012) Innate immunity in cystic fibrosis lung disease; J of Cystic Fibrosis. 11(5):363–382.
Farinha CM, Amaral MD. Most F508del-CFTR is targeted to degradation at an early folding checkpoint and independently of calnexin. Mol Cell Biol 2005; 25:5242-5252.
Khurtsilava I., Kvlividze O., Parulava Ts., Margvelashvili L. (2020) CFTR mutations and clinical manifestations in children diagnosed after neonatal screening. J. Exp and clinical medicine, 2:39-44.
Yaqin Xu and Stefan Worgall (2012). Immune Dysfunction in Cystic Fibrosis, Cystic Fibrosis - Renewed Hopes Through Research, Dr. Dinesh Sriramulu (Ed.), ISBN: 978-953-51-0287-8,
Courtney JM, Ennis M, Elborn JS. Cytokines and inflammatory mediators in cystic fibrosis. J Cyst Fibros. 2004 Dec;3(4):223-31. doi: 10.1016/j.jcf.2004.06.006. PMID: 15698939.
Taggart C, Coakley RJ, Greally P, Canny G, O’Neill SJ, McElvaney NG. Increased elastase release by CF neutrophils is mediated by tumour necrosis factor-alpha and interleukin-8. Am J Physiol Lung Cell Mol Physiol 2000;278:L33–41.
Fiorentino DF, Zlotnik A, Mosmann TR, Howard M, O’Garra A. IL-10 inhibits cytokine production by activated macrophages. J Immunol 1991;147:3815–22.
Magalhães, M., Rivals, I., Claustres, M. et al. DNA methylation at modifier genes of lung disease severity is altered in cystic fibrosis. Clin Epigenet 2017; 9:19.
Pineau F, Caimmi D, Taviaux S, Reveil M, Brosseau L, Rivals I, Drevait M, Vachier I, Claustres M, Chiron R, De Sario A. DNA Methylation at ATP11A cg11702988 Is a Biomarker of Lung Disease Severity in Cystic Fibrosis: A Longitudinal Study. Genes. 2021; 12(3):441.
Ghughunishvili M., SurmavaS., Tkemaladze T., Gagua M., Abzianidze E., Kvaratskhelia E. DNA methylation profile in Cystic Fibrosis patients with C677T variant of MTHFR gene2020, European Journal of Human Genetics. 2020; 28:740-741.
ჩამოტვირთვები
გამოქვეყნებული
როგორ უნდა ციტირება
გამოცემა
სექცია
